Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CENPFP49454 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CENPFP49454 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CENPFP49454 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC-2.17□□□□□ -2.76
CENPFP49454 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC-2.17□□□□□ -2.76
CENPFP49454 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CENPFP49454 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CENPFP49454 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC-2.17□□□□□ -2.76
CENPFP49454 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-2.17□□□□□ -2.76
CENPFP49454 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CENPFP49454 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CENPFP49454 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CENPFP49454 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CENPFP49454 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CENPFP49454 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CENPFP49454 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CENPFP49454 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CENPFP49454 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC-2.18□□□□□ -2.76
CENPFP49454 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC-2.18□□□□□ -2.76
CENPFP49454 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CENPFP49454 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CENPFP49454 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CENPFP49454 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC-2.18□□□□□ -2.76
CENPFP49454 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CENPFP49454 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CENPFP49454 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CENPFP49454 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CENPFP49454 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CENPFP49454 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CENPFP49454 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CENPFP49454 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CENPFP49454 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CENPFP49454 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CENPFP49454 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC-2.19□□□□□ -2.76
CENPFP49454 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CENPFP49454 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CENPFP49454 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC-2.19□□□□□ -2.76
CENPFP49454 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CENPFP49454 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC-2.19□□□□□ -2.76
CENPFP49454 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CENPFP49454 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CENPFP49454 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CENPFP49454 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CENPFP49454 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CENPFP49454 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CENPFP49454 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CENPFP49454 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CENPFP49454 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CENPFP49454 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CENPFP49454 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CENPFP49454 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CENPFP49454 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CENPFP49454 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CENPFP49454 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CENPFP49454 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CENPFP49454 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CENPFP49454 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CENPFP49454 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CENPFP49454 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-2.21□□□□□ -2.76
CENPFP49454 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CENPFP49454 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CENPFP49454 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CENPFP49454 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CENPFP49454 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CENPFP49454 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CENPFP49454 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CENPFP49454 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CENPFP49454 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CENPFP49454 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
CENPFP49454 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
CENPFP49454 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
CENPFP49454 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC-2.22□□□□□ -2.77
CENPFP49454 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
CENPFP49454 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
CENPFP49454 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CENPFP49454 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC-2.23□□□□□ -2.77
CENPFP49454 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CENPFP49454 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CENPFP49454 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CENPFP49454 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CENPFP49454 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-2.23□□□□□ -2.77
CENPFP49454 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CENPFP49454 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC-2.23□□□□□ -2.77
CENPFP49454 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CENPFP49454 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CENPFP49454 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CENPFP49454 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CENPFP49454 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CENPFP49454 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CENPFP49454 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CENPFP49454 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CENPFP49454 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CENPFP49454 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CENPFP49454 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CENPFP49454 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-2.24□□□□□ -2.77
CENPFP49454 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CENPFP49454 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC-2.24□□□□□ -2.77
CENPFP49454 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CENPFP49454 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CENPFP49454 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms