Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
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