Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
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CXCL3P19876 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CXCL3P19876 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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CXCL3P19876 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CXCL3P19876 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CXCL3P19876 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CXCL3P19876 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CXCL3P19876 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CXCL3P19876 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CXCL3P19876 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CXCL3P19876 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CXCL3P19876 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CXCL3P19876 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CXCL3P19876 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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CXCL3P19876 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CXCL3P19876 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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CXCL3P19876 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
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CXCL3P19876 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CXCL3P19876 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CXCL3P19876 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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CXCL3P19876 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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CXCL3P19876 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CXCL3P19876 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CXCL3P19876 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CXCL3P19876 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CXCL3P19876 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CXCL3P19876 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CXCL3P19876 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CXCL3P19876 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CXCL3P19876 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CXCL3P19876 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CXCL3P19876 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CXCL3P19876 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CXCL3P19876 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CXCL3P19876 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CXCL3P19876 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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