Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CSO75390 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CSO75390 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CSO75390 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CSO75390 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CSO75390 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CSO75390 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CSO75390 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CSO75390 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CSO75390 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CSO75390 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CSO75390 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CSO75390 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CSO75390 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CSO75390 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CSO75390 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CSO75390 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CSO75390 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CSO75390 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CSO75390 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CSO75390 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CSO75390 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CSO75390 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CSO75390 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CSO75390 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CSO75390 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CSO75390 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
CSO75390 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CSO75390 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CSO75390 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CSO75390 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CSO75390 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CSO75390 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CSO75390 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CSO75390 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CSO75390 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CSO75390 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CSO75390 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CSO75390 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CSO75390 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CSO75390 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CSO75390 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CSO75390 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CSO75390 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CSO75390 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
CSO75390 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSO75390 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSO75390 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSO75390 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSO75390 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSO75390 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSO75390 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSO75390 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSO75390 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSO75390 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSO75390 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSO75390 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSO75390 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSO75390 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CSO75390 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSO75390 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSO75390 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSO75390 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSO75390 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSO75390 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSO75390 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSO75390 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSO75390 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSO75390 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSO75390 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSO75390 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSO75390 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
CSO75390 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
CSO75390 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
CSO75390 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CSO75390 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CSO75390 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CSO75390 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CSO75390 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CSO75390 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CSO75390 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CSO75390 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CSO75390 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CSO75390 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CSO75390 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CSO75390 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CSO75390 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CSO75390 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CSO75390 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CSO75390 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CSO75390 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CSO75390 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CSO75390 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CSO75390 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CSO75390 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CSO75390 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CSO75390 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CSO75390 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CSO75390 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CSO75390 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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