Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHOC2Q9UQ13 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHOC2Q9UQ13 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHOC2Q9UQ13 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHOC2Q9UQ13 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHOC2Q9UQ13 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHOC2Q9UQ13 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SHOC2Q9UQ13 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHOC2Q9UQ13 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHOC2Q9UQ13 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHOC2Q9UQ13 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHOC2Q9UQ13 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHOC2Q9UQ13 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHOC2Q9UQ13 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHOC2Q9UQ13 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SHOC2Q9UQ13 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHOC2Q9UQ13 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHOC2Q9UQ13 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHOC2Q9UQ13 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHOC2Q9UQ13 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SHOC2Q9UQ13 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms