Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAX2Q9UIW0 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAX2Q9UIW0 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAX2Q9UIW0 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAX2Q9UIW0 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAX2Q9UIW0 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAX2Q9UIW0 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAX2Q9UIW0 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC0.53□□□□□ -2.32
VAX2Q9UIW0 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAX2Q9UIW0 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAX2Q9UIW0 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAX2Q9UIW0 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAX2Q9UIW0 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAX2Q9UIW0 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAX2Q9UIW0 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAX2Q9UIW0 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
VAX2Q9UIW0 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAX2Q9UIW0 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAX2Q9UIW0 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAX2Q9UIW0 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAX2Q9UIW0 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VAX2Q9UIW0 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
VAX2Q9UIW0 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.52□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms