Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY46

SCN3A, Sodium channel protein type 3 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN3AQ9NY46 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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SCN3AQ9NY46 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN3AQ9NY46 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
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SCN3AQ9NY46 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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SCN3AQ9NY46 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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SCN3AQ9NY46 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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SCN3AQ9NY46 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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SCN3AQ9NY46 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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SCN3AQ9NY46 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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SCN3AQ9NY46 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
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