Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMPD4Q9NXE4 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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