Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
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