Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC0.37□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC0.36□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TOP1MTQ969P6 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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