Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.41□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.42□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.45□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
C1orf140Q5VVS0 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
C1orf140Q5VVS0 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
C1orf140Q5VVS0 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
C1orf140Q5VVS0 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
C1orf140Q5VVS0 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms