Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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