Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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SIX1Q15475 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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