Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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PTPRKQ15262 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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