Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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PDE6HQ13956 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
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PDE6HQ13956 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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PDE6HQ13956 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
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PDE6HQ13956 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
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PDE6HQ13956 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
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