| RUNX2 | Q13950 | RNU1-96P-201 | ENST00000364163 | 162 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL139156.1-201 | ENST00000412785 | 841 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL162411.1-201 | ENST00000413145 | 526 nt | TSL 2 BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL390729.2-201 | ENST00000416137 | 156 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HMGN2P38-201 | ENST00000423806 | 265 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CST2P1-201 | ENST00000425770 | 87 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL513185.1-201 | ENST00000431638 | 162 nt | TSL 5 BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC245047.4-201 | ENST00000433189 | 144 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MRPS10P1-201 | ENST00000448483 | 130 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL23AP7-203 | ENST00000449021 | 469 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC090255.1-201 | ENST00000495779 | 349 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-635P-201 | ENST00000516651 | 102 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC023157.2-201 | ENST00000540596 | 141 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC104819.3-201 | ENST00000603264 | 540 nt | TSL 4 BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC005034.5-201 | ENST00000604219 | 466 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | 5S_rRNA.11-201 | ENST00000618635 | 84 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC127459.3-201 | ENST00000624328 | 466 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1309P-201 | ENST00000363305 | 108 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR873-201 | ENST00000401120 | 77 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR1253-201 | ENST00000408273 | 105 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.602-201 | ENST00000410535 | 92 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU2-61P-201 | ENST00000411069 | 191 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC009310.1-201 | ENST00000414414 | 451 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC069023.1-201 | ENST00000442231 | 221 nt | TSL 3 BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS27P21-201 | ENST00000486977 | 252 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TMEM132D-AS1-202 | ENST00000510001 | 293 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1146P-201 | ENST00000516282 | 102 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP003733.2-201 | ENST00000529409 | 171 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092138.2-201 | ENST00000563811 | 428 nt | TSL 5 BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC022254.1-201 | ENST00000567857 | 235 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR5094-201 | ENST00000578766 | 85 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4524B-201 | ENST00000581569 | 115 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010900.2-201 | ENST00000604508 | 210 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD113-5-201 | ENST00000607261 | 78 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.783-201 | ENST00000613546 | 102 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PI15-201 | ENST00000260113 | 6732 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CENPCP1-201 | ENST00000533085 | 2578 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD114-7-201 | ENST00000362520 | 77 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP276-201 | ENST00000362580 | 94 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU1-22P-201 | ENST00000363334 | 158 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP160-201 | ENST00000364866 | 120 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.329-201 | ENST00000365209 | 107 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.541-201 | ENST00000384640 | 113 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.574-201 | ENST00000384766 | 95 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR568-201 | ENST00000385036 | 95 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU2-2P-201 | ENST00000410396 | 191 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP100-201 | ENST00000410903 | 110 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP59-201 | ENST00000410922 | 110 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL23AP36-201 | ENST00000413895 | 458 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC244636.1-201 | ENST00000421152 | 228 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL445646.1-201 | ENST00000431784 | 216 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS26P55-201 | ENST00000471178 | 356 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-237P-201 | ENST00000515985 | 71 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | 5S_rRNA.3-201 | ENST00000517021 | 110 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC009930.1-201 | ENST00000522330 | 191 nt | TSL 5 BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC090124.1-201 | ENST00000525097 | 448 nt | TSL 3 BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008269.2-201 | ENST00000561915 | 1105 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4438-201 | ENST00000585271 | 93 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC006380.1-201 | ENST00000603598 | 186 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | 5S_rRNA.19-201 | ENST00000612131 | 110 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | 5S_rRNA.18-201 | ENST00000621941 | 110 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.84-201 | ENST00000363011 | 104 nt | BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-407P-201 | ENST00000365280 | 104 nt | BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-117P-201 | ENST00000365415 | 107 nt | BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU4-52P-201 | ENST00000384209 | 138 nt | BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-21P-201 | ENST00000384710 | 107 nt | BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SUMO1P2-201 | ENST00000452524 | 304 nt | BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS26P45-201 | ENST00000471748 | 340 nt | BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS27P22-201 | ENST00000478056 | 241 nt | BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SEPT14P8-201 | ENST00000508026 | 178 nt | BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC097462.1-201 | ENST00000514125 | 324 nt | BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP20-201 | ENST00000515976 | 84 nt | BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1143P-201 | ENST00000516125 | 104 nt | BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL137100.2-201 | ENST00000555786 | 315 nt | BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC012435.2-201 | ENST00000562869 | 361 nt | TSL 3 BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4299-201 | ENST00000577899 | 72 nt | BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4287-201 | ENST00000579398 | 78 nt | BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DEFB117-201 | ENST00000602356 | 141 nt | BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL161716.1-201 | ENST00000606365 | 273 nt | TSL 5 BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNFX1-AS1_2.1-201 | ENST00000610973 | 93 nt | BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF644-212 | ENST00000621077 | 2056 nt | TSL 5 BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PPP2R5A-205 | ENST00000537030 | 1719 nt | TSL 2 BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CEP57L1-201 | ENST00000359793 | 2515 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.172-201 | ENST00000363765 | 102 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.418-201 | ENST00000384029 | 102 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-505P-201 | ENST00000384427 | 107 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-296P-201 | ENST00000384608 | 107 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR515-2-201 | ENST00000384883 | 83 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR515-1-201 | ENST00000384884 | 83 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | EBAG9P1-201 | ENST00000418955 | 543 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL592431.2-201 | ENST00000422198 | 171 nt | TSL 3 BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL035415.1-201 | ENST00000447150 | 289 nt | TSL 5 BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL021397.1-201 | ENST00000451806 | 248 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010409.1-201 | ENST00000487382 | 476 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC103794.1-201 | ENST00000531763 | 197 nt | TSL 3 BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR3145-201 | ENST00000580727 | 82 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP001178.1-201 | ENST00000584679 | 268 nt | TSL 3 BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL096840.1-201 | ENST00000603287 | 93 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC069114.2-201 | ENST00000604699 | 304 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL627230.6-201 | ENST00000611129 | 280 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |