Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF2H3Q13889 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF2H3Q13889 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF2H3Q13889 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF2H3Q13889 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H3Q13889 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.6 ms