Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms