Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CACNA1SQ13698 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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