Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC0□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PMS2P3Q13401 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PMS2P3Q13401 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
PMS2P3Q13401 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PMS2P3Q13401 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PMS2P3Q13401 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PMS2P3Q13401 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PMS2P3Q13401 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PMS2P3Q13401 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PMS2P3Q13401 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PMS2P3Q13401 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PMS2P3Q13401 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PMS2P3Q13401 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PMS2P3Q13401 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PMS2P3Q13401 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PMS2P3Q13401 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PMS2P3Q13401 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PMS2P3Q13401 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
PMS2P3Q13401 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
PMS2P3Q13401 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms