Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
ITGB3BPQ13352 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ITGB3BPQ13352 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ITGB3BPQ13352 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ITGB3BPQ13352 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ITGB3BPQ13352 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC-0.36□□□□□ -2.47
ITGB3BPQ13352 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ITGB3BPQ13352 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ITGB3BPQ13352 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ITGB3BPQ13352 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ITGB3BPQ13352 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
ITGB3BPQ13352 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ITGB3BPQ13352 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ITGB3BPQ13352 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ITGB3BPQ13352 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ITGB3BPQ13352 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ITGB3BPQ13352 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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ITGB3BPQ13352 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ITGB3BPQ13352 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ITGB3BPQ13352 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ITGB3BPQ13352 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ITGB3BPQ13352 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ITGB3BPQ13352 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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ITGB3BPQ13352 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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ITGB3BPQ13352 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ITGB3BPQ13352 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
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ITGB3BPQ13352 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ITGB3BPQ13352 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
ITGB3BPQ13352 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
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ITGB3BPQ13352 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ITGB3BPQ13352 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
ITGB3BPQ13352 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
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ITGB3BPQ13352 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.39□□□□□ -2.47
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ITGB3BPQ13352 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ITGB3BPQ13352 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
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ITGB3BPQ13352 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
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ITGB3BPQ13352 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
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ITGB3BPQ13352 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
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ITGB3BPQ13352 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ITGB3BPQ13352 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
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