Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KLF1Q13351 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.4 ms