Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LMAN2Q12907 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
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