Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
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