Protein–RNA interactions for Protein: Q10713

PMPCA, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCAQ10713 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PMPCAQ10713 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
PMPCAQ10713 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PMPCAQ10713 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PMPCAQ10713 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMPCAQ10713 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMPCAQ10713 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMPCAQ10713 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMPCAQ10713 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMPCAQ10713 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMPCAQ10713 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMPCAQ10713 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMPCAQ10713 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMPCAQ10713 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMPCAQ10713 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMPCAQ10713 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PMPCAQ10713 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMPCAQ10713 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PMPCAQ10713 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMPCAQ10713 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMPCAQ10713 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMPCAQ10713 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PMPCAQ10713 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMPCAQ10713 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PMPCAQ10713 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PMPCAQ10713 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PMPCAQ10713 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
PMPCAQ10713 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PMPCAQ10713 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms