Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
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