Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SDSP20132 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SDSP20132 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SDSP20132 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SDSP20132 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SDSP20132 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SDSP20132 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SDSP20132 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SDSP20132 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SDSP20132 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SDSP20132 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SDSP20132 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SDSP20132 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SDSP20132 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SDSP20132 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SDSP20132 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SDSP20132 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SDSP20132 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SDSP20132 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SDSP20132 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SDSP20132 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SDSP20132 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SDSP20132 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SDSP20132 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SDSP20132 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SDSP20132 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SDSP20132 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SDSP20132 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SDSP20132 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SDSP20132 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SDSP20132 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SDSP20132 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SDSP20132 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SDSP20132 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SDSP20132 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SDSP20132 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SDSP20132 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SDSP20132 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SDSP20132 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SDSP20132 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SDSP20132 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SDSP20132 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SDSP20132 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SDSP20132 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SDSP20132 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SDSP20132 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SDSP20132 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SDSP20132 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SDSP20132 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SDSP20132 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SDSP20132 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SDSP20132 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SDSP20132 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SDSP20132 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SDSP20132 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SDSP20132 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SDSP20132 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SDSP20132 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SDSP20132 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SDSP20132 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SDSP20132 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SDSP20132 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SDSP20132 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SDSP20132 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SDSP20132 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SDSP20132 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SDSP20132 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SDSP20132 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SDSP20132 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SDSP20132 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SDSP20132 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SDSP20132 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SDSP20132 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SDSP20132 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SDSP20132 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SDSP20132 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SDSP20132 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SDSP20132 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SDSP20132 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SDSP20132 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SDSP20132 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SDSP20132 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SDSP20132 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SDSP20132 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SDSP20132 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SDSP20132 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SDSP20132 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SDSP20132 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SDSP20132 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SDSP20132 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SDSP20132 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SDSP20132 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SDSP20132 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SDSP20132 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SDSP20132 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SDSP20132 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SDSP20132 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SDSP20132 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SDSP20132 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SDSP20132 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms