Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ERVV-1B6SEH8 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms