Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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