Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
C1orf140Q5VVS0 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C1orf140Q5VVS0 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C1orf140Q5VVS0 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C1orf140Q5VVS0 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C1orf140Q5VVS0 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C1orf140Q5VVS0 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
C1orf140Q5VVS0 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C1orf140Q5VVS0 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C1orf140Q5VVS0 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C1orf140Q5VVS0 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C1orf140Q5VVS0 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C1orf140Q5VVS0 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C1orf140Q5VVS0 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C1orf140Q5VVS0 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C1orf140Q5VVS0 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC-0.38□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
C1orf140Q5VVS0 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
C1orf140Q5VVS0 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms