Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
SSX1Q16384 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.3 ms