Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC0.34□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCN9AQ15858 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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