Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
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