Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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