Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.5□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC0.49□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.49□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC0.47□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
MDC1Q14676 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
MDC1Q14676 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
MDC1Q14676 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
MDC1Q14676 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms