Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC-0.39□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
CDK13Q14004 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
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