Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
APOFQ13790 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
APOFQ13790 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
APOFQ13790 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
APOFQ13790 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
APOFQ13790 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
APOFQ13790 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
APOFQ13790 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
APOFQ13790 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
APOFQ13790 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
APOFQ13790 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
APOFQ13790 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
APOFQ13790 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
APOFQ13790 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
APOFQ13790 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
APOFQ13790 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC0.43□□□□□ -2.34
APOFQ13790 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
APOFQ13790 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.43□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
APOFQ13790 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
APOFQ13790 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
APOFQ13790 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
APOFQ13790 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
APOFQ13790 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
APOFQ13790 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
APOFQ13790 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
APOFQ13790 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
APOFQ13790 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
APOFQ13790 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
APOFQ13790 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
APOFQ13790 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
APOFQ13790 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
APOFQ13790 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
APOFQ13790 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
APOFQ13790 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
APOFQ13790 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
APOFQ13790 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
APOFQ13790 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
APOFQ13790 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
APOFQ13790 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
APOFQ13790 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
APOFQ13790 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
APOFQ13790 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
APOFQ13790 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
APOFQ13790 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
APOFQ13790 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
APOFQ13790 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
APOFQ13790 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
APOFQ13790 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
APOFQ13790 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
APOFQ13790 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
APOFQ13790 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
APOFQ13790 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
APOFQ13790 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
APOFQ13790 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
APOFQ13790 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
APOFQ13790 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
APOFQ13790 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
APOFQ13790 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
APOFQ13790 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
APOFQ13790 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms