Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms