Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATRQ13535 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATRQ13535 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATRQ13535 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATRQ13535 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATRQ13535 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATRQ13535 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATRQ13535 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.2 ms