Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PRPF4BQ13523 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PRPF4BQ13523 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PRPF4BQ13523 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PRPF4BQ13523 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PRPF4BQ13523 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PRPF4BQ13523 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PRPF4BQ13523 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PRPF4BQ13523 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
PRPF4BQ13523 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
PRPF4BQ13523 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PRPF4BQ13523 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PRPF4BQ13523 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PRPF4BQ13523 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PRPF4BQ13523 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PRPF4BQ13523 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PRPF4BQ13523 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PRPF4BQ13523 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PRPF4BQ13523 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PRPF4BQ13523 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PRPF4BQ13523 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PRPF4BQ13523 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PRPF4BQ13523 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PRPF4BQ13523 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PRPF4BQ13523 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PRPF4BQ13523 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PRPF4BQ13523 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PRPF4BQ13523 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PRPF4BQ13523 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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