Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms