Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC-1.53□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC-1.55□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC-1.55□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC-1.55□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC-1.55□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-1.56□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC-1.56□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC-1.57□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC-1.57□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC-1.57□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.58□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.8 ms