Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ERVV-1B6SEH8 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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