Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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SCN8AQ9UQD0 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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SCN8AQ9UQD0 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
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SCN8AQ9UQD0 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
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SCN8AQ9UQD0 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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SCN8AQ9UQD0 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
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SCN8AQ9UQD0 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
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SCN8AQ9UQD0 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
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SCN8AQ9UQD0 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
SCN8AQ9UQD0 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
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