Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TM7SF3Q9NS93 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TM7SF3Q9NS93 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TM7SF3Q9NS93 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TM7SF3Q9NS93 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
TM7SF3Q9NS93 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TM7SF3Q9NS93 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TM7SF3Q9NS93 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TM7SF3Q9NS93 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TM7SF3Q9NS93 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TM7SF3Q9NS93 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TM7SF3Q9NS93 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TM7SF3Q9NS93 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TM7SF3Q9NS93 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TM7SF3Q9NS93 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TM7SF3Q9NS93 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
TM7SF3Q9NS93 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.9 ms