Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms