Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTU2Q2VPK5 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
CTU2Q2VPK5 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
CTU2Q2VPK5 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CTU2Q2VPK5 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTU2Q2VPK5 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTU2Q2VPK5 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTU2Q2VPK5 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTU2Q2VPK5 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.9 ms