Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
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