Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SNAPC1Q16533 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNAPC1Q16533 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNAPC1Q16533 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNAPC1Q16533 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNAPC1Q16533 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNAPC1Q16533 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNAPC1Q16533 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNAPC1Q16533 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNAPC1Q16533 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNAPC1Q16533 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNAPC1Q16533 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNAPC1Q16533 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNAPC1Q16533 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SNAPC1Q16533 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNAPC1Q16533 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNAPC1Q16533 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SNAPC1Q16533 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNAPC1Q16533 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SNAPC1Q16533 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SNAPC1Q16533 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
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