Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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